时效性是建筑工程预算的基础特性，由于事前预算和事中预算弱化，各项预算工作无法及时落实，预算结果欠缺准确性，容易在合同签订、招投标等环节集中爆发风险。预算法规体系是与预算有关的各项法律、条例、细则的整合，作为预算的基本依据，预算法规体系的完整度影响预算效率和质量。预算在工程预算中忽视预算法规的制定和调整，导致预算法规体系不完整，对预算对象的辨别无据可依，预算资源配置不合理，预算人员无法顺利开展工作。乌鲁木齐工程预算目前对建筑工程预算的理论和实践尚未成熟，还未建立起针对建筑行业的一整套预算法规体系，预算思路落后，部分预算手段陈旧，不符合现行预算要求，在面对复杂问题时无法有效地分析和解决。要杜绝预算过程中预算人员徇私枉法、滥用职权等情况，需要健全的预算法规体系。然而我国建筑工程预算尚未具备完善的规则体系，削弱了预算报告的权威性。预算信息化建设是新时期预算工作发展的根本要求，要缓解预算人力不足矛盾，提高预算质量，就必须预算信息化水平。我国建筑工程预算仍停留在手工预算阶段，电算化预算进展缓慢，硬件配置滞后，没有确立电子数据预算查询、分析、取证和保密制度，在预算资源共享上还没有制定统一的标准。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。
工程预算设计部门应当加强以下几个方面的工作：
1）工程预算项目的设计单要严把质量关，保证所提交的工程设计具有较高的质量；
2）应当明确职责并与奖金挂钩，发挥绩效的积极作用；
3）应当有计划有目标地培养技术骨干，通过请专家来对企业员工进行培训、单位工程竣工验收程序：工程竣工验收由建设单位组织勘察、工程预算编制、施工、监理等单位和其他有关方面的专家进行工程验收。（1）单位工程完工后，施工单位自行组织检查评定，并向建设单位提出交工验收投告。（2）建设单位收到工程验收报告后，应由建设单位（项目）负责人组织施工（合分包单位）、工程预算编制、监理等单位（项目）负责人进行单位（子单位）工程验收。
工程预算随着我国经济的迅速发展 加强了基本建设力度在取得巨大成就的同时也出现了一些值得重视的问题。如某些施工单位为了追求自身的利益，在基建工程上营私舞弊，频频出现高估冒算的现象。根据以往工作经验，进行工程决算审计常发现的问题有：多列工程项目、工程量不实、高套定额、乱取费用等问题。为了管理好并合理使用基建资金提高投资效益和维护建设方利益加强基建工程决算的审计工作非常重要。开展工程决算审计主要从以下几个方面入手。