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施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
保证资金合理、有效的使用，减少资金利息支出和损失；严格合同管理，作好工程索赔价款结算；强化项目法人责任制，落实项目法人对铜仁工程预算管理工作的主体地位，在法人组织内建立与造价紧密结合的经济责任制；社会咨询（监理）机构要为项目法人积极开展铜仁工程预算提供全过程、的咨询服务，遵守职业道德，确保服务质量；各造价管理部门要强化服务意识，强化基础工作（定额、指标、价格、工程量、造价等信息资料）的建设，为建设铜仁工程预算的合理确定提供动态的可靠依据；各单位、各部门要组织造价工程师的选拔、培养、培训工作，促进人员素质和工作水平的提高。铜仁工程预算管理目标是：按经济规律，根据市场，利用科学管理方法和手段，合理确定铜仁工程预算和有效地控制造价。铜仁工程预算合理控制就是在建设程序的各个阶段合理确定投资估算、概算造价、承包合同价、结算价、竣工结算价。铜仁工程预算有效控制主要体现以下几个方面：以设计阶段为重点的全过程造价控制:实行设计招投标和设计方案竞选工程设计招投标的目的是：鼓励竞争，促进设计单位改进管理，采用先进技术，降低铜仁工程预算，缩短工期，以技术先进、结构合理、满足建筑节能和改善环境等为要求，整体提高投资效益。设计概算是设计文件的重要组成部分，是在投资估算的控制下由设计单位根据初步设计（或扩大初步设计）图纸及概算定额（或概算指标）、各项费用定额或取费标准（指标）、设备、材料预算价格等资料，编制和确定的建设项目从筹建至竣工交付使用所需全部费用文件。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。
施工组织设计的工程预算编制依据
(1)计划文件，包括 批准的基本建设计划文件、单位工程项目一览表、分期分批投产的要求、投资指标和设备材料订货指标、建设地点所在地区主管部门的批件、施工单位主管上级下达的施工任务等；
(2)设计文件，包括批准的初步设计或技术设计、设计说明书、总概算或修正总概算、可行性研究报告；
(3)合同文件，即施工单位与建设单位签订的工程承包合同；
(4)建设地区的调查资料，包括气象、地形、地质和其他地区性条件等结算过程其他注意事项结算的工程量以竣工图为准，竣工图不清之处，预算人员要得到工程管理中心的确认或到工地现场进行实地测量；尤其对图纸未标注、规范无特别要求，现场实际施工又提高标准的项目一定要有现场工程师文件确认并符合工程合同要求后才能给予按实结算。
