南通工程预算按设计图纸进行概预算：由于项目工程体系中存在的不合理流程，使得现实中的南通工程预算概预算往往是在设计图纸之后再进行计算，会产生大量的返工现象。而南通工程预算的往往也只是根据工程设计图纸产出，一旦图纸不规范或者不合理，南通工程预算很难对造价成本进行合理计算。其次，我国的造价体系参考的标准跟新的相对较慢，与市场存在着一定的偏差，同时由于图纸存在这一定的偏差和返工，往往对工程项目建设的成本产生较大的偏差。由于在设计过程中，会产生的一定返工，通常对返工的过程进行造价的成本概预算的次数就会增加，增加了人力成本的浪费。南通工程预算一定程度上限制工程设计形式的实现：当限制南通工程预算时，对工程设计的形式和内容及其功能会存在着很大程度上的限制，尤其是功能，可能会有所欠缺，当工程的建设尚未形成模式化的时候，单独的工程设计会成本比机械模式化的成本高，反之，南通工程预算一定程度上决定了工程设计的个性化或是模式化。比如普通的正方形钢架结构与鸟巢的钢架结构设计所需的资金就存在一定的差异，造价成本的限制，也使得工程建设模式化，建筑缺乏特色，无法展现工程本身特色。工程设计、概预算、施工等尚未形成合理体系：中国工程建设体系起步较晚，因此存在着很不不合理的地方，同时往往对国外工程建设流程照搬照抄，缺乏合理性，如工程设计、施工、监理、预算单位往往不是同一个单位，同时彼此缺乏联系沟通，因此在同一个工程项目上存在着不合理、不规范等问题，往往导致工程重新开始新一遍流程。同时由于先后顺序的不合理，使得工程的前期进度无法迅速化进行，从而导致了人力成本、物力成本的增加，因此，完善工程项目建设流程体系变的尤为重要。完善工程项目建设流程体系：完善工程项目建设流程体系，减少返工现象，实现同步到位，减少人力、物力成本。完善南通工程预算体系，对接现实市场机制，改变设计、施工、申报等单位一体化，实现专业化工程项目建设一体化，完善工程建设专业化，提高建设领域管理，实现工程设计与南通工程预算的合理化与有效性。
南通工程预算利用工程定额规定的工作内容进行审查，验证工程决算工程量与定额中规定的工作内容是否一致来确定工程造价的真实性、合理性的一种审计技术方法。如某年我们对某单位一基建项目进行审计，从决算书中查出屋面防水工程子目中SBS防水以包含冷底子油的工作内容及其造价，施工单位报送的决算书中又单独计算冷底子油子目明显多计工程；由于SBS防水卷材铺贴时使用的是热熔法（北方），不需要在做沥青胶泥粘贴，甲方签证4mm的沥青胶泥不属实，SBS防水卷材在制造工艺中已含该部分内容，该建设项目工程决算重复工作内容报价、甲方违背原则不负责任签证工程造价核减10.6万元。把握和利用好审计方法，是搞好工程造价审计工作的一个捷径。其实把握好审计方法并不难，审计的方法多种多样，也是因人而宜的。只要在工作中多做多动脑筋，做到嘴勤、手勤、眼勤及掌握的专业技术知识，在今后的造价审计工作中一定会有更好更的方法。在目前审计审计任务日益繁重 ，而审计力量相对有限的情况下 ，审计人员如何根据工程项目的实际情况选择工程造价审计方法，以便提高审计效率，又快又好地完成审计任务随着 经济快速发展及投资的增长，建设项目投资审计受到社会各界的空前重视。工程造价审计是政府投资项目审计的重要组成部分，特别在节约建设资金、提高项目管理水平方面具有显著作用。近年来，随着政府基本建设力度的加大，投资审计倍受社会各界关注，各级政府部门对投资高重视，这对审计和审计人员来说，既是一种鼓励，也是一种鞭策和压力然而，政府投资项目审计任务繁重与审计力量不足之间的矛盾 ，一直是困扰政府投资项目审计事业发展的重大问题。（某经济特区政府投资项目审计监督条例》第三十条规定“审计进行项目竣工决算审计，应当自被审计单位交齐本条例第二十八条规定的资料之日起四十五日内出具审计结论性文书。
工程签证是施工合同和施工图中未包括，且预算定额取费也未考虑的，而实际施工中又确实发生费用的内容，需要做现场工程签证。一般由承包商提出，监理工程师或发包商核实签字批准。工程签证产生的原因主要有由于不可预见的因素产生的工程签证。如基础开挖时，发现有软弱下卧层等不良地基，需进行换填，这时需发包商现场管理人员核实后工程签证。一般来说在合同当中会就此做出相应的规定，例如因恶劣天气、一周内累计超过8小时的停水停电等造成的工期工程签证、经济工程签证等。由于发包商原因等非承包商原因，工程中途停建、缓建或未按合同规定的时间和要求提供材料、场地、设备资料等造成承包商的停工、窝工、返工而发生的倒运、人员和机械的调迁、二次搬运等损失。与设备安装工程等其他工程交叉作业产生的工程签证。（4）因设计变更等原因造成的工程量的增加，由发包商现场管理人员根据设计人员出具的设计变更通知单进行现场工程签证。（5）对于翻修项目、零星维修项目很难出正规的施工图纸，往往在施工前由承包商提出一套方案，经发包商同意，南通工程预算维修完毕后再按核实工程量进行工程签证。根据FIDIC条款第52条的规定，当合同中有相应的计价项目时，原则上应按其相应项目的合同单价计价。计价时需将变更、签证工程分解或合并成若干项与合同规定相对应的计价项目，根据其完成的工程量及相应的单价变更、签证工程的计量支付。这样做的好处是可以充分发挥合同价格的作用，有效的避免双方协商单价时的争议以及对合同正常履行带来的影响。当合同单价明显不合理或工程量变化太大时，原则上是只要有损公平原则或出现显失公平的现象，原有的合同单价就应进行变更。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。