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污水处理菌种按其功能首要分为以下几类：

1. 污水处理菌种硝化菌：是一种好氧性菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。日子在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的人物。广泛存在大自然各个旮旯，空气、江河、大海、土壤都有，生物学中发现的硝化菌有几千种之多。

2. 污水处理菌种 反硝化菌：反硝化菌是一种能引起反硝化作用的菌。多为反硝化杆菌、斯氏杆菌、萤气极毛杆菌等。它们在氙气条件下，运用硝酸中的氧，氧化物质而获得自身生命活动所需的能量。反硝化菌广泛散布于土壤、厩肥和污水中。能够将硝态氮转化为氮气而不是氨氮。首要应用于污水处理,如景观水治理,城市河道治理,水产养殖处理等。