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工程预算审计方法还有很多各有各的优缺点 ，要提高审计效率，关键是要会选择。政府投资项目范围广泛 ，各项目的建设难度、标准也不一致。另外，政府工程经常受到人为因素和自然条件的影响，往往建设时间长，存在较多的设计变更和现场签证 ，有的项目在审计时已经发生变化 ，甚至无法进行现场取证。这些因素决定了工程预算审计具有多样性、复杂性和风险性。因此，选择审计方法时，既要考虑不同的审计阶段和审计内容，还要结合审计目标，注意审计方法之间的交叉使用和外部审计条件的许可，做到有的放矢、科学使用。
编制标底应以设计图纸为依据，标底价格及工期的计算应执行 或地区所颁发的概(预)算定额和有关规定。人工、机械、台班及材料价格的变动因素，施工不可预见费或包干系数以及工程需要增加的措施费等应列标底；标底是否正确首先取决工程量表是否正确，因而在工程量表中要尽量减少漏项，并尽可能计算无误，力争计算工程量的误差控制在实际工程量的±5%以内，以防止加漏项和工程量差别太大而引起的索赔；标底是由主业主组织专门人员为准备招标的那一部分工程或设备，或工程和设备都有而计算出的一个合理的基本价格。济宁工程预算它不等于工程(或设备)的概预算，也不等于合同价格。标底是招标单位的绝密资料，不能向任何元关人员泄漏。我国国内大部分工程在招标评标时，均以标底上下的一个幅度(5%-10%)为判断投标是否合格的条件。标底一般是以概预算为基础编制的，标底价:包括招标工程总预算，单元预算，钢材、木材、水泥总用量及其单方用量，其中没有三材指标而需要议价采购的应注明其数量、单位价差及差价总金额，招标工程总预算中的所含各项费用的说明，包括包干系数或不可预见费用的说明和工程特殊技术措施费的说明。
工程预算按照现场地形及种植苗木花草的不同，选择对应的技术措施。对于选择的技术措施，要进行核查。如果选用机械，要核查选用机械的规格参数、工作台班；如果乔灌木在栽植过程中选择支撑，要按不同规格的苗木核查选择支撑的种类，再按支撑的种类汇总数量。生态环境得到了前所未有的重视，为了提高城市的生活质量，政府开始大规模开展绿化建设。由于绿化建设是近些年才开始得到重视，所以在工程预算审计方面存在着一定的问题，绿化建设工程化和普通的建设工程之间有着很大的不同，审计工作人员需要结合绿化工程的实际特点开展工作，才能保证绿化工程预算审计工作质量。
通过相应的政策改变可以控制整体工程的造价，我国目前的设计费用是由工程总体造价来决定的，设计人员会从工程总体造价中抽取一定百分比的酬劳，这项政策是建筑行业一直以来的一个弊端，对控制工程预算十分不利，许多设计人员会因此通过不合理的材料采购或者故意进行高额的工程预算预算来提高工程预算，政府和相关的企业可以通过一系列的奖励和惩罚措施。另外，在审计的过程中，也要对设计人员的设计方案进行严格审查，发现不合理的地方要及时纠正，对于故意抬高工程预算的设计方案要坚决淘汰，这样才能体现出工程审计的作用，审计人员一定要尽职尽责，尽可能的保证工程质量的同时降低工程预算的成本。在具体的设计施工前双方会签订有效的施工合同，在之后的设计方案评选中，相关部门会对有关的图纸设计文件进行严格的审查。加大审查力度的同时，可以提高设计人员的自觉意识。
